问：建筑工程一般计税时增值税税率为9%,简易计税时增值税征收率为3%,两者相差6%,拨付工程款是否要扣除6%税款?
答：营改增后，住建部门修改了有关工程计价的方法，参见《》()。
目前，工程造价要求按照”税前工程造价×(1+9%)“来计算。其中，税前工程造价为人工费、材料费、施工机具使用费、企业管理费、利润和规费之和，各费用项目均以不包含增值税可抵扣进项税额的价格计算。目前并未针对简易计税方法下如何计算工程造价做出具体规定。但发包方绝对不能简单粗暴地直接扣掉6%的“税差”。
简易计税方法下，如果按照“税前工程价款×(1+3%)”结算工程价款，意味着施工方只拿到了销售环节应该缴纳的3%的增值税，而拿到的“税前工程造价”是不含税的价款，也就是，施工方没有获得采购环节的全部价税合计成本。
换一个思路，如果工程价款中增值税税金按照3%计算的话，工程价款应该按照“税后工程造价×(1+3%)”。此处所谓”税后工程造价”是指造价中的人工费、材料费、施工机具使用费、企业管理费、利润和规费等应该包含相应增值税。
当然，从发包方角度来讲，取得不同税率的发票，成本和税负是不一样的。甲乙双方一定会针对工程结算价款有一番讨价还价，但直接扣减6%税额是不对的。